一、氮肥吸收
1、增加氮源吸收形式
菌根中的菌丝体不但可以吸收NH4+和NO3-形式的氮肥，还可以以氨基酸的形式吸收。在吸收NH4+时，还会释放H+，酸化难容性磷，促进对磷的吸收。
2、活化土壤养分
丛枝菌根菌能够增加植物释放有机酸、葡萄酶、球囊霉素等成分，改变土壤的理化性质，进一步活化土壤中的养分。
二、磷肥吸收
1、增加了磷的吸收区域
土壤磷的空间有效性是限制植物吸收磷素的关键因素之一，增加植物对土壤磷的吸收区域，是提高土壤磷空间有效性的重要途径。对于非菌根植物，根毛的数量和长度成为了影响磷素吸收的主要因子。而菌根植物更加依赖根外菌丝的延伸来扩大植物的磷吸收区域。这种外延作用可以吸收离根表8-27厘米的磷分。另外菌根结构的根外菌丝直径仅有（2-4μm），而根毛直径为（10μm左右），因此根外菌丝能够进入根毛无法触及的土壤间隙，细化了土壤磷的利用率。
2、提高磷运转能力
菌丝拥有对无机磷酸盐较高亲和力的磷转运子，在土壤中有更强的磷转运能力。